MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402

Total Repeats: 48562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011999	ATA	2	6	17	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011999	ATT	2	6	28	33	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011999	TG	3	6	117	122	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011999	ATT	2	6	164	169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011999	T	8	8	172	179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011999	ATTT	2	8	222	229	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011999	TG	3	6	240	245	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011999	ATAA	2	8	256	263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011999	TTA	2	6	275	280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011999	TAT	2	6	282	287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011999	A	6	6	315	320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011999	AT	3	6	341	346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011999	ACC	2	6	460	465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222150251
14	NC_011999	AGT	2	6	467	472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222150251
15	NC_011999	CTT	2	6	487	492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222150251
16	NC_011999	CAAA	2	8	510	517	75 %	0 %	0 %	25 %	222150251
17	NC_011999	AAG	2	6	535	540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222150251
18	NC_011999	TCT	2	6	585	590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222150251
19	NC_011999	AAT	2	6	606	611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222150251
20	NC_011999	AAG	2	6	616	621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222150251
21	NC_011999	AAGA	2	8	629	636	75 %	0 %	25 %	0 %	222150251
22	NC_011999	CAA	2	6	639	644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222150251
23	NC_011999	ATA	2	6	682	687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222150251
24	NC_011999	TTAT	2	8	780	787	25 %	75 %	0 %	0 %	222150251
25	NC_011999	GTT	2	6	870	875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222150251
26	NC_011999	ATGA	2	8	897	904	50 %	25 %	25 %	0 %	222150251
27	NC_011999	TTA	2	6	907	912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222150251
28	NC_011999	TTC	2	6	970	975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222150251
29	NC_011999	TGA	2	6	980	985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222150251
30	NC_011999	GAA	2	6	1020	1025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222150251
31	NC_011999	TTC	2	6	1026	1031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222150251
32	NC_011999	GAAA	2	8	1094	1101	75 %	0 %	25 %	0 %	222150251
33	NC_011999	AGA	2	6	1112	1117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222150251
34	NC_011999	ATTA	2	8	1145	1152	50 %	50 %	0 %	0 %	222150251
35	NC_011999	AAGA	2	8	1196	1203	75 %	0 %	25 %	0 %	222150251
36	NC_011999	AGA	3	9	1208	1216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222150251
37	NC_011999	CGAA	2	8	1231	1238	50 %	0 %	25 %	25 %	222150251
38	NC_011999	ATT	2	6	1374	1379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222150251
39	NC_011999	CTA	2	6	1381	1386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222150251
40	NC_011999	GAA	2	6	1560	1565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222150251
41	NC_011999	TGG	2	6	1568	1573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222150251
42	NC_011999	TAC	2	6	1583	1588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222150251
43	NC_011999	A	6	6	1613	1618	100 %	0 %	0 %	0 %	222150251
44	NC_011999	A	6	6	1643	1648	100 %	0 %	0 %	0 %	222150251
45	NC_011999	AC	3	6	1718	1723	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_011999	CTATTA	2	12	1791	1802	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_011999	A	6	6	1813	1818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011999	TA	3	6	1824	1829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011999	TACAA	2	10	1867	1876	60 %	20 %	0 %	20 %	222150252
50	NC_011999	ACT	2	6	1881	1886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222150252
51	NC_011999	AAC	2	6	1930	1935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222150252
52	NC_011999	GAA	2	6	2048	2053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222150252
53	NC_011999	TTG	2	6	2103	2108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222150252
54	NC_011999	A	7	7	2116	2122	100 %	0 %	0 %	0 %	222150252
55	NC_011999	CTG	2	6	2127	2132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222150252
56	NC_011999	AAGT	2	8	2241	2248	50 %	25 %	25 %	0 %	222150252
57	NC_011999	GAA	3	9	2249	2257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222150252
58	NC_011999	CAAA	2	8	2300	2307	75 %	0 %	0 %	25 %	222150252
59	NC_011999	TAAACT	2	12	2419	2430	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	222150252
60	NC_011999	AGA	2	6	2431	2436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222150252
61	NC_011999	CGA	2	6	2446	2451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222150252
62	NC_011999	ATT	2	6	2462	2467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222150252
63	NC_011999	ATT	2	6	2498	2503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222150252
64	NC_011999	TTTA	2	8	2551	2558	25 %	75 %	0 %	0 %	222150252
65	NC_011999	ATT	2	6	2620	2625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222150252
66	NC_011999	TAA	2	6	2656	2661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222150252
67	NC_011999	TTA	2	6	2696	2701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222150252
68	NC_011999	TTA	2	6	2724	2729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222150252
69	NC_011999	ATA	2	6	2745	2750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222150252
70	NC_011999	ATC	2	6	2761	2766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222150252
71	NC_011999	ATG	2	6	2858	2863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222150252
72	NC_011999	TGCGT	2	10	2866	2875	0 %	40 %	40 %	20 %	222150252
73	NC_011999	CGA	2	6	2941	2946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222150252
74	NC_011999	AATT	2	8	2964	2971	50 %	50 %	0 %	0 %	222150252
75	NC_011999	T	8	8	3011	3018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011999	GAA	2	6	3121	3126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222150253
77	NC_011999	TGG	2	6	3186	3191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222150253
78	NC_011999	ACA	2	6	3208	3213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222150253
79	NC_011999	GAT	2	6	3222	3227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222150253
80	NC_011999	TCA	2	6	3247	3252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222150253
81	NC_011999	ATTA	2	8	3280	3287	50 %	50 %	0 %	0 %	222150253
82	NC_011999	ATA	2	6	3299	3304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222150253
83	NC_011999	GAG	2	6	3319	3324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222150253
84	NC_011999	A	6	6	3391	3396	100 %	0 %	0 %	0 %	222150253
85	NC_011999	ATT	2	6	3419	3424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222150253
86	NC_011999	A	7	7	3460	3466	100 %	0 %	0 %	0 %	222150253
87	NC_011999	GAA	2	6	3469	3474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222150253
88	NC_011999	A	6	6	3494	3499	100 %	0 %	0 %	0 %	222150253
89	NC_011999	ATT	2	6	3534	3539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222150253
90	NC_011999	AGA	2	6	3663	3668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222150253
91	NC_011999	TG	3	6	3671	3676	0 %	50 %	50 %	0 %	222150253
92	NC_011999	TG	3	6	3681	3686	0 %	50 %	50 %	0 %	222150253
93	NC_011999	TAAA	2	8	3692	3699	75 %	25 %	0 %	0 %	222150253
94	NC_011999	TGT	2	6	3708	3713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222150253
95	NC_011999	CAAG	2	8	3726	3733	50 %	0 %	25 %	25 %	222150253
96	NC_011999	GAAA	3	12	3749	3760	75 %	0 %	25 %	0 %	222150253
97	NC_011999	ATG	2	6	3836	3841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222150253
98	NC_011999	A	8	8	3894	3901	100 %	0 %	0 %	0 %	222150253
99	NC_011999	TGA	2	6	3927	3932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222150253
100	NC_011999	GGT	2	6	3967	3972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222150253
101	NC_011999	GAA	2	6	4015	4020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222150254
102	NC_011999	TCT	2	6	4041	4046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222150254
103	NC_011999	AAAG	2	8	4175	4182	75 %	0 %	25 %	0 %	222150254
104	NC_011999	AAG	3	9	4199	4207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222150254
105	NC_011999	GAA	2	6	4238	4243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222150254
106	NC_011999	GAT	2	6	4421	4426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222150254
107	NC_011999	TGA	2	6	4437	4442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222150254
108	NC_011999	TTA	2	6	4467	4472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222150254
109	NC_011999	TAT	2	6	4558	4563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222150254
110	NC_011999	ATTA	2	8	4568	4575	50 %	50 %	0 %	0 %	222150254
111	NC_011999	ATT	2	6	4634	4639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222150254
112	NC_011999	TC	3	6	4647	4652	0 %	50 %	0 %	50 %	222150254
113	NC_011999	GAT	3	9	4708	4716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222150254
114	NC_011999	TGCCAT	2	12	4720	4731	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222150254
115	NC_011999	TA	3	6	4741	4746	50 %	50 %	0 %	0 %	222150254
116	NC_011999	GAA	2	6	4760	4765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222150254
117	NC_011999	ATC	2	6	4826	4831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222150254
118	NC_011999	TA	3	6	4856	4861	50 %	50 %	0 %	0 %	222150254
119	NC_011999	GTTTA	2	10	4966	4975	20 %	60 %	20 %	0 %	222150254
120	NC_011999	TTC	2	6	5021	5026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222150254
121	NC_011999	ATT	2	6	5096	5101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222150254
122	NC_011999	TAT	2	6	5104	5109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222150254
123	NC_011999	ATC	2	6	5114	5119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222150254
124	NC_011999	TAC	2	6	5121	5126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222150254
125	NC_011999	CGC	2	6	5134	5139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222150254
126	NC_011999	AT	3	6	5144	5149	50 %	50 %	0 %	0 %	222150254
127	NC_011999	AAT	2	6	5214	5219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222150254
128	NC_011999	ATTA	2	8	5258	5265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011999	AATT	2	8	5285	5292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011999	GAT	2	6	5337	5342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222150255
131	NC_011999	TGC	2	6	5370	5375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222150255
132	NC_011999	ATT	2	6	5380	5385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222150255
133	NC_011999	TCAAA	2	10	5386	5395	60 %	20 %	0 %	20 %	222150255
134	NC_011999	AAGA	2	8	5398	5405	75 %	0 %	25 %	0 %	222150255
135	NC_011999	CAT	2	6	5529	5534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222150255
136	NC_011999	AT	3	6	5607	5612	50 %	50 %	0 %	0 %	222150255
137	NC_011999	CAA	2	6	5734	5739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222150255
138	NC_011999	AGA	3	9	5766	5774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222150255
139	NC_011999	AGC	2	6	5802	5807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222150255
140	NC_011999	AGC	2	6	5871	5876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222150255
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156	NC_011999	T	6	6	6508	6513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_011999	TA	3	6	6532	6537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_011999	ATT	2	6	6630	6635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_011999	ATC	2	6	6670	6675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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269	NC_011999	AGA	2	6	10979	10984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222150259
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271	NC_011999	CTG	2	6	11199	11204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222150259
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393	NC_011999	GA	3	6	16143	16148	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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397	NC_011999	GAG	2	6	16243	16248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
398	NC_011999	ATT	2	6	16272	16277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222150263
399	NC_011999	AGAAC	2	10	16279	16288	60 %	0 %	20 %	20 %	222150263
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500	NC_011999	GGTGGC	2	12	21200	21211	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding

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